En primer lugar gracias a todos por las ideas. Probé con otro USB distinto con menos canciones y ahora sí que lo reconoce en qué canción estaba cuando se apagó el coche. Que yo sepa el puerto USB del coche es USB 2.0, por lo que no sé hasta qué punto la velocidad de lectura de cada pincho podría ser el problema.
@Ralph_IT Tengo el mismo caso, USB FAT32 DE 32GB, le llevo muy lleno pero en el anterior coche no me dio problemas. En el Honda tarda mucho en reconocerlo y no guarda nunca memoria de por qué canción se llegaba.
Haré pruebas esta semana y formatearé de nuevo el USB de 32gb para ver si empieza a leer más rápido.
@Bendi Ni siquiera sabía que el USB del reposabrazos fuese de datos, creí que no tenía conexión con la tablet y era solamente de corriente.
Muchas gracias a todos, cuando haga más pruebas os cuento por si en un futuro le ocurre a alguien.